Tutkimus, jossa tutkijat ovat käyttäneet uutta lähestymistapaa bioinformaattiseen analyysiin, on myös laajentanut tunnettujen mikrobigeenien luetteloa 3 miljoonasta 10 miljoonaan.
Tämän Nature Biotechnology -lehden sunnuntaina julkaiseman tutkimuksen tulokset ovat osa eurooppalaista MetaHIT-hanketta (Metagenomics Human Intestinal Tract), jolle on osoitettu 11, 4 miljoonaa euroa tutkimaan miten ihmisen mikrobiome liittyy terveyteen ja sairauksiin . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) on yksi 13: sta tässä hankkeessa osallistuvasta - ja ainoa espanjalainen keskus - johdossa tohtori Francisco Guarnerin johdolla, joka selitti, että kaikilla tutkituilla näytteillä ei ole tätä tuntematon laji.
Joidenkin yksilöiden suolistofloranäytteissä on hyvin vähän näitä lajeja, ja kun niitä on tarkasteltu yksityiskohtaisesti, he ovat havainneet, että ne ovat näytteitä Crohnin tautia sairastavista potilaista. "Tämä viittaa siihen, että nämä lajit, toistaiseksi tuntemattomat, ovat mahdollisesti niitä, jotka tekevät eron terveiden ihmisten ja sairaiden mikrobiootan välillä", Guarner ilmoitti.
"Hyvät bakteerit"
Tutkijan mukaan nämä tiedot avaavat strategioita näiden lajien palauttamiseksi ravitsemuksellisilla toimenpiteillä: annettaessa kuituja, prebiootteja, jotka auttavat joidenkin lajien selektiivistä kasvua, tai probiootteja.
Nämä tuntemattomat bakteerit ovat todennäköisesti ns. "Hyviä bakteereja", koska ne eivät ole tyypillisiä, jotka aiheuttavat tartunnan, eikä niitä tunneta tai eristetä aiemmin. Guarnerin mukaan löydettyjä bakteereja ei voida eristää, koska "melkein varmasti ne eivät selviäisi paksusuolen ulkopuolella elinsiirtoon".
VHIR: n fysiologian ja ruuansulatuskanavan patofysiologian ryhmän työstä vastaava henkilö ja tutkija on todennut, että löydettyjä uusia lajeja "ei voida viljellä, ne ovat erittäin herkkiä happea varten, ts. Ne ovat erittäin tiukkoja anaerobia ja muodostavat suuren riippuvuuden ympäristöstään voidakseen selviytyä. " "Samasta syystä, kun menimme tietokantoihin, emme löytäneet jälkeä ja emme toistaiseksi tienneet niistä mitään", Guarner sanoi.
Eri metagenomiset lajit
Löytö on ollut mahdollista uuden bioinformaattisen analyysin lähestymistavan ansiosta, jonka avulla nämä lajit "pintaan".
"Guarnerin mukaan vain 10% sekvensoidusta geneettisestä materiaalista tunnetaan tällä hetkellä 95% luotettavuudella. Tämä jättää valtavan harmaan alueen, jota parhaillaan kehitetään."
Tutkimuksessa on havaittu 741 erilaista metagenomista lajia, jotka on nimetty siitä, että niille ei ole mahdollista antaa nimeä. Kun tutkitaan tietokantoja, tutkijat ovat havainneet, että 115 näistä lajeista oli jo tiedossa, kun taas 518 ei tunneta; loput 108 tunnetaan osittain.
"Nyt tiedämme, miltä näiden metagenomisten lajien genomi näyttää, mutta ei niiden nimiä ja sukunimiä", Guarner selitti.
On pieni joukko lajeja, joita ei tunneta, mutta niiden sukupuolta tai perhettä, johon ne kuuluvat, ja noin 200 kuvatuista metagenomisista lajeista ei voida luokitella millään tavalla, koska yli 80% niiden geeneistä on täysin tuntemattomia tänään.
Henkilöllä on 600 000 mikrobigeeniä
Tutkijoiden mukaan ihmisissä eläviä mikro-organismeja on noin 100 miljardia, 10 kertaa enemmän kuin ihmisen solujen kokonaismäärä.
Saman projektin alustavat tulokset, vuonna 2010, osoittivat 3 300 000 erilaista geeniä, jotka on käännetty 20 000 eri toiminnaksi, joista 5000 oli toistaiseksi täysin tuntematon.
Jokaisella ihmisellä on noin 600 000 näitä mikrobigeenejä ja 300 000 toistuu jatkuvasti kaikkien yksilöiden keskuudessa. "Tässä uudessa tutkimuksessa lukumäärä kerrotaan kolmella ja saavutetaan 9 879 896 erilaista geeniä", Guarner sanoi.
Lähde: www.DiarioSalud.net
